Programme Interdisciplinaire du CNRS « AMAZONIE » 2008-2010
Partenaires : UMR 5557 LEM (Ecologie Microbienne), Lyon I, UMR 8172 ECOFOG, Kourou, collaboration scientifique de solicaz
Chimio-Diversité des EXsudats racinaires d’arbres et leur rôle écologique dans le fonctionnement microbien du sol en relation avec la nutrition azotée : C-DEX
En forêt Amazonienne, où la biodiversité végétale compte parmi les plus importantes de la planète, les notions de niches écologiques et de complémentarités fonctionnelles sont essentielles afin de comprendre les interactions complexes existant entre les différentes espèces. Cette complémentarité fonctionnelle peut-être illustrée par les stratégies d’acquisition azotée des arbres en forêt tropicale. Par exemple, Eperua falcata, préfère systématiquement le NO3–. L’hypothèse majeure de ce projet était que cette préférence est pilotée par des interactions entre l’arbre et la microflore du sol via les exsudats racinaires (i.e. inhibition de la dénitrification). Afin de caractériser le rôle des composés chimiques dans la médiation des interactions biotiques (écologie chimique), les relations entre chimiodiversité des exsudats racinaires et biodiversité/fonctionnement des communautés bactériennes ont été étudiées par des approches in situ et in vitro. La caractérisation de fractions et/ou de molécules actives a été réalisée par des fractionnements bio-guidés.
Les résultats obtenus ont mis en évidence (i) la présence de flavonoïdes de type liquiritigénine dans les exsudats racinaires d’Eperua et de son précurseur dans les racines, l’isoliquiritigénine, ii) une différentiation des composés exsudés en fonction de la morphologie racinaire certainement liée à l’âge de la racine et, (iii) un effet inhibiteur de ces composés sur la vitesse de croissance de souches bactériennes dénitrifiantes couplé à une diminution de l’abondance des dénitrifiants de type nirK dans la rhyzosphère. Ces résultats cela nous conduit à formuler des hypothèses concernant le rôle écologique des composés identifiés par rapport à la stratégie d’acquisition du N de cette espèce.
